方法简介：

转录因子是一类调控基因转录过程的关键DNA结合蛋白，这类蛋白通常含有DNA结合功能域和其他协同蛋白的结合位点。通常情况下，转录因子可以结合到一些基因启动子区附近的一些短的片段区域，最终，一些转录因子对基因的转录效果可以描述为分子开关，它们的结合与否直接决定了该基因是否转录表达，在真核细胞当中，可以实现这些蛋白的改造来活化或者抑制基因的表达。活化蛋白（Activator）一般可以结合部份DNA片段来帮助活化mRNA转录过程，这些片段被称为增强子（enhancer）。活化蛋白同增强子结合后可以带来DNA的构象改变，甚至招募RNA聚合酶（RNA polymerase）起始转录。另一方面，抑制蛋白（repressor）通过招募组蛋白去乙酰化酶（histone dacetylase）来抑制转录起始。ChIP-seq测序（Chromatin Immunoprecipitation）是一种在全基因组范围内检测蛋白结合位置、组蛋白修饰发生位置的高通量技术，ChIP-seq能高分辨，低噪声，广覆盖的检测蛋白的结合位点，相比于传统的ChIP-chip技术，ChIP-seq对DNA的样品起始量要求为纳克级别，在经过蛋白DNA交联、片段化之后，通过特异性抗体对片段的富集，针对性的检测这些被抗体富集到的片段，从而通过生物信息学的分析，有效的找到蛋白或者组蛋白修饰的位点。纽科生物提供优质的一站式ChIP-seq测序服务，结合多年积累经验、优化的实验流程、使用超高信噪比的试剂，快速准确的捕获相关DNA片段信号，帮助客户找到感兴趣的分子或者修饰所在的靶基因区域，更好的进行下游分子实验。

产品优势：

1）一站式服务：提供从样品处理、建库、测序和分析等的全套服务

2）项目经验丰富：多种转录因子的实验经验、优化的实验流程、高信噪比的试剂选择

3）周期短，性价比高

4）提供发表级图表，可以在公司云平台调整

5）专业生物信息学分析团队，满足个性化分析需求

服务流程：

结果展示：

经典案例：

案例推荐1：TET2 通过对增强子的去甲基化实现基因表达活化

原文：TET2 coactivates gene expression through demethylation of enhancers

期刊：Science

案例解析：TET2（tet methylcytosine dioxygenase 2） 可以催化DNA上的5mC甲基化类型到5hmC类型的转变，但是TET2在多种人类癌症细胞中会发生异常表达或者突变，这种异常会影响DNA甲基化的状态改变。通过ChIP-seq技术可以检测并分析TET-2介导的基因表达调控模式，通过ChIP-seq数据分析发现，内源性的TET2可以占有活化的增强子进一步招募雌激素受体alpha，对TET2的敲除可以让DNA的大部分位置甲基化水平增高，减弱雌激素应答。

通过ChIP-seq数据分析发现TET2招募ERalpha

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MeRIP m6A LncRNA测序，circRNA测序，转录组测序，单细胞ATAC测序，单核ATAC测序

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