方法简介：
Ac4C(N4-acetylcytidine)是转录后修饰大家族中的又一重要成员，主要发生在tRNA和rRNA。最近研究发现，ac4C也在人、酵母等高等生物的mRNA广泛存在[1]。Ac4C的发生主要依赖writer蛋白NAT10(N-acetyltransferase 10)。NAT10催化的ac4C修饰可以影响18S rRNA对核糖体的生物合成，mRNA发生ac4C修饰时，可以影响其稳定性和翻译过程，在tRNA方面，ac4C可以影响tRNA结构和解码效率。基于这些ac4C修饰对RNA的结构和稳定性带来的巨大影响，ac4C对生命体病理生理过程同样造成较大的影响。已有的研究显示，相比于对照样本，在肺纤维化[2]、间质性膀胱炎[3]、氧化应激[4]等样本中，ac4C的整体水平均有明显的差异改变，总体来讲，ac4C修饰水平的异常可能会对改变RNA代谢过程，进而影响如代谢类疾病、癌症、免疫相关、自身免疫性疾的发生发展。纽科生物借助ac4C特异性抗体，在全转录组范围内对ac4C片段进行富集，基于免疫沉淀过程，结合二代测序从而进行acRIP-seq，通过计算分析、比对和计算获得可靠的ac4C peak，即ac4C位点。相比于m6A修饰，有关ac4C的相关研究较少，有关分子机制和疾病之间的关系研究仍是当下表观转录组学的热点。
产品优势：
1）一站式服务：提供从样品处理、acRIP富集、建库、测序和分析等的全套服务
2）项目经验丰富：多种样品类型的acRIP mRNA-seq测序和分析
3）周期短，性价比高
4）提供发表级图表，可以在公司云平台调整
5）专业生物信息学分析团队，满足个性化分析需求
服务流程：
结果展示：
经典案例：
案例推荐1：mRNA ac4C修饰增强mRNA翻译效率
原文：Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency.
期刊：Cell
案例解析：由NAT10催化进行的RNA ac4C化学修饰是表观转录组学的重要组成部分，通过高通量的acRIP-seq测序方法分析检测ac4C位点并进行基因区域注释，发现ac4C修饰主要富集于mRNA的编码区，通过NAT10的人工干预能够明显降低ac4C位点的修饰水平，同时发现被ac4C修饰基因发生下调。此外，ac4C修饰的mRNA分子半衰期和NAT10有明显相关性，且体内实验和体外实验都证明NAT10可以增强底物的翻译效率。该研究的结果表明，相比较于m6A，ac4C富集于CDS的5’端，能一定程度上增强被修饰mRNA的稳定性，而m6A主要富集于终止密码子附近，分布偏向于3’端且使底物稳定性下降。
NAT10敲除导致ac4C修饰的mRNA差异表达和半衰期变化
案例推荐2：哺乳动物中对ac4C对翻译起始的直接调控
原文：Direct epitranscriptomic regulation of mammalian translation initiation through N4-acetylcytidine
期刊：Molecular Cell
案例解析：最新发表的Molecular Cell文章指出，ac4C对于mRNA的翻译影响是依赖于修饰位置的，ac4C发生在mRNA的不同位置，对翻译的影响效果不同，且影响的方式也有不同。在编码区内的ac4C可以增强翻译过程延申，在5’UTR区域的ac4C修饰通过产生“抑制性的结构(repressive structure)”来抑制翻译起始，同时影响和tRNAMet的相互作用。
acRIP-seq结果显示ac4C修饰富集于First CDS location区域
参考文献
1. Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency
2. Metabolomics analysis identifies novel plasma biomarkers of cystic fibrosis pulmonary exacerbation
3. Role of urinary cations in the aetiology of bladder symptoms and interstitial cystitis
4. Identification and Quantification of Modified Nucleosides in Saccharomyces cerevisiae mRNAs
MeRIP m6A LncRNA测序，circRNA测序，转录组测序，单细胞ATAC测序，单核ATAC测序
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